Preriscaldate il forno a 200°.
Lavate e asciugate bene tutti gli ortaggi. Mondate le zucchine, dividetele a metà per la lunghezza, poi in quarti e iniziate a ricavare tanti pezzettini non troppo piccoli, ma tutti delle stesse dimensioni.
Sistemateli in una pirofila rettangolare di vetro atta alla cottura ad alte temperature. Fate lo stesso con le melanzane e i peroni, mondateli e riduceteli a tocchetti. Uniteli agli zucchini, mescolate per distribuire uniformemente le verdure.
In una ciotola, versate il pangrattato, il basilico, il timo, il sale e grattugiate il formaggio. Amalgamate le polveri e utilizzatele per cospargere gli ortaggi in modo omogeneo.
Tagliate in due i pomodori e grattugiateli, per estrarre solo la polvere, incorporate una presa di sale e tenete a portata di mano.
Sminuzzate la mozzarella, distribuitela sulla pirofila, quindi versate il condimento al pomodoro appena realizzato. Fate un secondo strato di mozzarella, livellate la superficie e infornate per 45 minuti circa. Sfornate e spolverate con altro parmigiano mentre è ancora calda, quindi servite.
